1951 yılında Mardin Derik’te dünyaya gelen Aydın Ayaydın, İstanbul İktisadi ve Ticari İlimler Akademisi’nden mezun olmuştur. 1977 yılında Anadoluhisarı Gençlik ve Spor Akademisi’nde iktisat asistanı olarak göreve başlamış, ardından 1978 yılında İTİA İşletme Yüksek Okulu’nda ve daha sonra İTİA Ekonomi Fakültesi’nde asistan olarak görev almıştır.
1983 yılında Marmara Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü’nde ekonomi dalında yüksek lisansını tamamlayan Ayaydın, 1985 yılında ekonomi doktoru ünvanını elde etmiştir. Marmara Üniversitesi İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi Ekonometri bölümünde, 1986 yılında yardımcı doçent, 1988 yılında doçent ve 1993 yılında ekonometri profesörü olarak akademik kariyerine devam etmiştir.
Aydın Ayaydın, Takvim, Sabah ve Vatan gazetelerinde ekonomi, siyaset ve güncel konularla ilgili köşe yazıları kaleme almış; bugüne kadar 12 bilimsel kitap ve birçok makale ile akademik alandaki birikimini paylaşmıştır. Ayrıca, Beşiktaş Kulübü’nde Asbaşkanlık ve Basın Sözcülüğü gibi önemli görevler üstlenmiş olan Ayaydın, evli ve üç çocuk babasıdır.